光华讲坛——社会名流与企业家论坛第6549期
主 题:空间转录组数据中的统计方法
主讲人:香港中文大学(深圳)数据科学学院刘瑾副教授
主持人:统计学院林华珍教授
时间:2024年5月31日(周五)下午4:00-5:00
举办地点:柳林校区弘远楼408会议室
主办单位:统计研究中心和统计学院 科研处
主讲人简介:
刘瑾博士,香港中文大学(深圳)数据科学学院副教授、校长学者。曾任新加坡国立大学Duke-NUS医学院助理教授,芝加哥伊利诺大学助理教授。主要参与统计计算及其在统计遗传/基因组学中的应用研究,当前研究方向包括TWAS(全转录组关联分析)、孟德尔随机和单细胞、空间转录组数据整合研究。作为第一/通信作者把相关系列研究发表在 Nature Communications, Nucleic Acids Research, Gut, Briefings in Bioinformatics, Bioinformatics, Biometrics, Biostatistics,IEEE Transactions on Information Theory等杂志,迄今为止发表SCI论文80余篇。四次获得新加坡教育部颁发的学术研究基金(AcRF Tier 2),获得国家自然科学基金面上项目资助。
内容简介:
空间分辨转录组学(spatially resolved transcriptomics,SRT)包含一组最新开发的生物技术,这些技术可同时表征组织的基因表达谱,并且保留有关其物理位置的信息。因此,SRT组学提供了与组织切片相关的基因表达模式的图谱排列,能够将结构和活性相连接,使研究人员能够在细胞水平上阐明生物之间的相互作用,从而为复杂组织(如肿瘤微环境)提供新的见解。报告人将针对SRT数据分析的几个统计问题,提出解决方案,利用SRT数据发现新的生物学(癌症)机制。